Re-make da série de TV de 1999. Monstros Assustadores... Criaturas Exóticas... Vastas Riquezas... Tesouros Ocultos... Enclaves Maléficos... Terras Desconhecidas... O "desconhecido" é mágico e pessoas Incríveis são atraidas por esta magica. Essas pessoas são conhecidas como Hunter. Gon é um garoto cujo pai desaparecido há muito tempo, sendo um Hunter. Ele acredita que se ele também poderia seguir o caminho de seu pai, ele poderia um dia se reunir com ele. Depois de fazer seus 12 anos, Gon deixa sua casa e assume a tarefa de entrar no exame Hunter, famoso por sua taxa de sucesso baixa e alta probabilidade de morte para se tornar um Hunter oficial. Com o desenvolver da trama ele encontra amigos fiés que o ajudaram em sua jornada.

A história gira em torno de um estudante pobre chamado Satou You. Satou vai ao supermercado um dia e descobre um bento (refeição pronta) à venda pela metade do preço. Assim quando ele chega para agarrá-lo, ele acaba no chão inconsciente. Satou acaba de entrar na feroz, batalha de sobrevivência sem barreiras do supermercado, pelo bento por metade do preço.

Amano Yukiteru, um garoto solitário que não é muito bom com as pessoas. Ele prefere escrever um diário em seu telefone celular e falar com seu amigo imaginário, Deus Ex Machina - O Deus do Tempo e do Espaço. No entanto, Yuki logo descobre que Deus é mais do que uma invenção da sua imaginação quando ele faz Yuki participar de uma batalha real com onze outros. Os competidores são dados diários especiais que podem prever o futuro, cada um diário possuindo características únicas que lhe dão vantagens e desvantagens. Dentro dos próximos 90 dias, os competidores devem tentar sobreviver até que haja apenas um sobrevivente. O vencedor vai se tornar o novo Deus do Tempo e do Espaço.

Em um futuro próximo, um meteorito cai carregando um vírus estrangeiros no Japão, levando uma infecção devastadora em todo o país e a anarquia total. Uma organização internacional conhecida como GHQ com a lei marcial e restaura a ordem para o Japão ao custo de sua independência. Este incidente torna-se conhecido como o Natal Perdido. Dez anos depois, em 2039, Ouma Shuu - um adolescente com uma habilidade especial despertado pelo vírus Apocalypse - atende Yuzuriha Inori , uma menina estranha que o incita a aderir à luta contra as forças de robótica da organização governamental e uma sociedade secreta cujo objetivo permanece envolta em mistério.